基因组研究飞速跃进

来源:百度文库 编辑:神马文学网 时间:2024/04/29 23:52:57

基因组测序进入“流水线”时代

基因组研究的重要性毋庸置疑,它可以解释人类重大疾病发病机理,有助于开展个性化预测、预防和治疗。还能促进对人类群体遗传学以及人类进化历史的研究。它开启的生物医学研究市场规模如此庞大,以至于无法用准确数字来描述。然而基因组测序并绘制图谱,一直被认为是极其复杂的事情。

“人类基因组计划”绘制首份基因组草图由多国科学家联手,历时10年,耗资30亿美元。就在几年前,轻易绘制一个图谱仍是不可思议的事情。现在,同样的工作,一个由几人组成的研究小组,可以在一天之内以不到1万美元的成本完成。这个费用在未来3年到5年内有可能降到1000美元以内,而时间预计只需15分钟左右。

测序成本直线下降当然是技术进步的结果。最初的“人类基因组计划”使用的是第一代DNA测序法,也称作“自动化桑格测序法”,其原理由两度获得诺贝尔化学奖的英国科学家桑格在上世纪70年代提出。

现在普遍使用的是新一代DNA测序技术,如果对两代技术的特点进行比较,第一代技术可以说是“线性的”,仪器每次运行只能读取有限几个“道”上的测量数据;新一代技术则是“平面的”,仪器每次运行可以读取整个平面上成千上万个测量点的数据。这一技术的升级换代,犹如汽车生产用上了流水线,是一个划时代的进步。

有关专家介绍,“千人基因组计划”一下子就使用了约180人的全基因组测序数据,正是采用了新一代DNA技术。专家希望,该计划的最终成本为3000万到5000万美元。若使用目前标准的DNA测序技术,同样工作可能需要花费5亿美元以上。

《自然》杂志的调查显示,由于技术和方法上的进步,在10月底之前科学界至少将完成至少2700份基因组图谱,而到2011年年底前,这一数量会超过3万份。美国加利福尼亚大学基因专家拉斯穆斯·尼尔森在《自然》上撰文表示:“欢迎进入基因研究的新阶段!”



传承“人类基因组计划”

“人类基因组计划”于1990年启动,2000年工作草图绘制完毕,3年后正式完成了全部30亿个碱基对的测序工作。科学家称赞这个计划比人类登上月球还要伟大。

“人类基因组计划”的最主要目标在于寻找诸如癌症和痴呆症等疑难杂症的遗传学根源,以为每个病人量身打造符合其基因特征的药物。然而,自“人类基因组计划”完成以来,因为难以同时对许多人进行基因测序,基因组研究一直只在较小的层面上进行。而“千人基因组计划”不仅使大规模测序成为可能,本次还绘制了一个详尽的基因图谱以供比对,这正是对“人类基因组计划”终极目标的延续。

据报道,“千人基因组计划”由中国深圳华大基因研究院、美国国立人类基因组研究所、英国桑格研究所等机构于2008年启动,该计划的最终目标是获得欧、亚、美、非各洲不同人群中2500人的基因数据,预计在2012年发布的最终结果将可以覆盖99%以上的基因变种。深圳华大基因研究院不仅承担了400个黄种人全基因组样本的测序和分析工作,还帮助完成了非洲人群的全部测序和分析任务。

据悉,该计划预计总共检测全球27个族群总计2500人的全部基因组信息。其中具体族群的代表人群包括:尼日利亚伊巴丹地区的约鲁巴人;居住于东京的日本人;居住于北京的中国人;居住于美国犹他州的北欧和西欧人后裔;居住于肯尼亚的卢亚人(Luhya)和马萨伊人;意大利的托斯卡尼居民;居住于美国休斯敦的Gujarati印第安人;居住于美国洛杉矶的墨西哥裔居民;居住于美国西南部的非洲人后裔等。

《自然》和《科学》杂志28日公布的报告是该计划第一阶段的成果。