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《灵枢·经脉篇》云：“经脉者、所以能决生死。处百病，调虚实、不可不通。”经络学说包涵着宇宙的天地之理。经络是经脉和络脉的总称，是按一定时间和顺序运行的。人与自然界是统一的整体，诸十二经脉者，皆系于生气之原。
十二经脉是经络系统的主体，具有表里经脉相合，与相应脏腑络属的主要特征。包括手三阴经（手太阴肺经、手厥阴心包经、手少阴心经）、手三阳经（手阳明大肠经、手少阳三焦经、手太阳小肠经）、足三阳经（足阳明胃经、足少阳胆经、足太阳膀胱经）、足三阴经（足太阴脾经、足厥阴肝经、足少阴肾经），也称为“正经”。
十二正经的运行的时间和顺序
手太阴肺经（寅时3点—5点）→手阳明大肠经（卯时5点—7点）→足阳明胃经（辰时7点—9点）→足太阴脾经（巳时9点—11点）→手少阴心经（午时11点—13点）→手太阳小肠经（未时13点—15点）→足太阳膀胱经（申时15点—17点）→足少阴肾经（酉时17点—19点）→手厥阴心包经（戌时19点—21点）→手少阳三焦经（亥时21点—23点）→足少阳胆经（23点—1点）→足厥阴肝经（丑时1点—3点），经过一个循环，在接手太阴肺经，进行下一次循环。手之三阴胸走手，手之三阳手走头，足之三阳头走足，足之三阴足走腹。
肺经
呼吸系统、甲状腺、皮肤
大肠经
结肠、直肠、上呼吸道（副鼻窦、咽喉为主） 颜面下部皮肤、口腔
胃经
胃、乳腺、膝关节
脾经
免疫、内分泌、肿瘤、结石
心经
心脏、血管、大脑、神志
小肠经
十二指肠、空肠、回肠、肩关节
膀胱经
脊椎、泌尿、生殖系统、关节
肾经
生殖、泌尿系统、腰、脑、耳、骨骼系统
心包经
心脏、血管
三焦经
淋巴系统、炎症
胆经
胆囊、胆道、神经、微血管、呼吸
肝经
肝脏、眼、生殖器、神经、筋膜
奇经八脉包括督脉、任脉、冲脉、带脉、阴维脉、阳维脉、阴跷脉、阳跷脉。它们与十二正经不同，既不直属脏腑，又无表里配合关系，“别道奇行”，故称“奇经”。
八脉之中尤任、督二脉最为重要。在整个性命双修修炼过程中作用极大，古曰：任督两脉人身之子午也，乃丹家阳火阴符升降之道，坎水离火交媾之乡。李时珍《奇经八脉考》中曰 “凡人有此八脉，俱属阴神闭而不开，惟神仙以阳气冲开，故能得道，八脉者先天之根，一气之祖。” 古曰：“生我之门死我户，几个醒来几个悟”。八脉起于会阴穴，又归于生死窍，故耳丹家将生死窍视为八脉之总根。上通泥丸，下达涌泉，真气集散，周流一身，气合自然，阴消阳长，待到水中火发，雪里开花，黄芽可得矣。 开通奇经，人就会感到周身经络气血通畅，精力充沛。历代祖师奉为绝秘，在各丹经、道书中均无泄露。“ 饶君聪慧过颜闵，不遇明师莫强猜。只为金丹无口诀，教君何处结灵胎。”
纯阳吕真人玄牝歌
玄牝之門號金母，先天先地藏真土。
含元抱一賴生成，一氣綿綿亙今古。
華池神水天地根，煉之餌之命長存。
自古神仙無別法，皆因玄牝立其根。
玄牝之門人不識，想腎存心謾勞力。
神仙破盡諸旁門，往往愚迷猶自執。
借問如何是玄牝，嬰兒初生先兩腎。
兩腎中間一點明，逆為丹母順成人。
一陽萌處急下手，黑中取白無中有。
一時辰內管丹成，九載叁年徒自守。
世人若識真玄牝，不在心兮不在腎。
窮取生身受氣初，莫怪天機都泄盡。
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