PCR注意事项

来源:百度文库 编辑:神马文学网 时间:2024/04/28 21:37:52
1.5.1 PCR的操作注意事项
◆模板:
PCR所用的模板一般稀释至纳克数量级,并保存于-20。C。闭环DNA模板的扩增效率略低于线性DNA。当使用高分子量的DNA(>10kb)作模板时,如用限制性内切酶先行消解(靶序列中没有此酶切位点),则扩增效率更好。
PCR所用的模板一般使用量为:
哺乳动物基因组DNA  1.0ug DNA。
酵母                 1~10ng
细菌                 10ng~100ng
质粒                 0.1ng~10ng
◆引物:
标准PCR反应(不限制引物数量)每条引物的典型浓度时0.1~0.5umol/L(即6×1012~3×1013个分子)。该浓度扩增1kbDNA片段少于30个循环的PCR反应绰绰有余,更高浓度的引物可能引起错配,导致非特异性扩增。
买来的引物应先离心几秒钟后,加入一定量的TE至引物浓度为40μM,保存于-20。C。
使用时,稀释成20uM,避免反复冻融。
◆dNTP:
在MgCl2  1.5mmol/L条件下,每种dNTP的浓度一般在200~250umol/L之间。
高浓度dNTP(>4mmol/L)对扩增反应起抑制作用。因为dNTP与Mg2+螯合而引起。如扩增片段在约1kb长度。每种dNTP浓度控制在20 umol/L至0.5~1.0pmd/L,可能会使扩增产物获得满意产率。
普通PCR用的dNTP浓度为2.5mM,保存于-20。C避免反复冻融。
在-20。C长期保存的dNTP少量水分会蒸发,然后凝结在管壁上,因此使用前要离心几秒钟。
◆Mg2+:
通常缓冲液中Mg2+最佳浓度时1.5mmol/L。
适当增加Mg2+浓度可以减少非特异性引导。
◆DNA聚合酶:常规PCR。 rTaqE每个标准的25~50ul反应体系用0.5~2.5单位。