蝴蝶兰病毒的PCR 引物

来源:百度文库 编辑:神马文学网 时间:2024/05/06 10:30:35
编号
病毒名称
引物序列F/R
1
INSV (Impatiens necrotic spot virus)
凤仙花坏死斑病毒
INSV-F1   ATTTAACACAACACAAAGCAAAC   23nt
INSV-R1   CGAATTTCACAAGTTTAATGATTT   24
INSV-F2   CAGTGCATCAAAATTATATCTAGCCG   26
INSV-R2   TACACTAGTTCAAATGTTCTTTCTAC    26
2
ORSV(Odontoglossum ringspot virus) 齿兰环斑病毒
ORSV-F1  ACGCACAATCTGATCCGTA   19
ORSV-R1  ATCCGCAGTGAAAACCC    17
3
CYMV (Cymbidium mosaic virus)
建兰花叶病毒
CYMV –F1  GAAATAATCATGGGAGAGCC   20
CYMV –R1  AGTTTGGCGTTATTCAGTAGG  21
4
ORSV和
CYMV
ORSV-F2   CCACCGAACTTACTGAAG   18
ORSV-R2   TGTCGTAAGGTTGACCACTC  20
CyMV-F2   GCTACCGCCGCCATCGTCAT    20
CyMV-R2   GCGCAGCACGTTCACGGTCA   20
5
TSWV
(Tomato spotted wilt virus)番茄斑萎病毒
TSWV-F1  CCCGGA TCCA GA GCAA T   17
TSWV-R1  CA C TGGA TCC TTTTG TTTTTG TTTTTTG   28
6
OFV
(Orchid fleck virus)
兰花斑点病毒
OFV-F1  TACTGATGCTGATGCCACTCTTT   23
OFV-R1   ACCCAACTGGGAGAGACTCTATT   23
7
CalMMV (Calanthe mild mosaic virus) 虾脊兰轻型花叶病毒
CalMMV-F1  GGA TGC TGG ACT CAG TGC T  19
CalMMV-R1  GTGCATATTCGTGTTCACAT  20
CalMMV-F2   GCT GGA CTC AGT GCT GAG A   19
CalMMV-R2    GTTCTCCTCCTGCGTTGCTAT  21
8
CMV (Cucumber mosaic virus) 黄瓜花叶病毒
CMV –F1   CGG ATG CTA ACT TTA GAG TCT TGT   24
CMV –R1   GAATGCGTTGGTGCTCGAT   19
9
DVNV (Dendrobium vein necrosis virus) 石斛脉坏死病毒

10
PhCSV (Phalaenopsis chlorotic spot virus) 蝴蝶兰褪绿斑病毒
PhCSV –F1   CAA GGG CAA GAA GGC AGT AT  20
PhCSV –R 1   CATACGAGCATTGACGTCAGA   21
PhCSV –R 2   GTTCCCATCCAAACCAAATAGT   22
11
Potexvirus属通用引物
potex-F1   CAYCARCARGCMAARGAYGA   20
potex-R1   AGCATRGCNSCRTCYTG   17
12
Tospoviruses番茄斑萎属简并引物
Tospo-F1     CC(A⁄T) TT(A⁄G) ACA GT(A⁄T⁄G)GA(A⁄G) ACAT
Tospo-R1   CAT(A⁄T⁄G)GC (A⁄G)CA AGA (A⁄G)TG (A⁄G)TA(A⁄T⁄G)AC AGA
Tospo-R2   TCATC(A⁄G) GA(A⁄G) TG(A⁄T⁄G⁄C) AC(A⁄C) ATCCA(T⁄C) CT
13
辣椒褪绿病毒(Capsicum chlorosis virus)CaCV
CaCV-F1   ATGTCTACTGCAAAGAGTGC  20
CaCV-R1   CACAGAAATCAACTAAACCT   20
CaCV-F2   TCACACTTCTATAGATGAGCT  21
CaCV-R2   GACTTTCACAAATTGCTTGA  20
14
香石竹斑驳病毒(Carnation mottle virus)CarMV
CarMV-F1   AATCCCACTGTGCAAACATT  20
CarMV-R1   TAACCGAAGGGACCACATAC   20
15
Potyvirus简并引物
Poty-F1   GTTTTCCCAGTCACGAC   17
Poty-R1     GGXAAYAAYAGYGGXCAZCC  20
16
TMV烟草花叶病毒
Tobacco mosaic virus
TMV-F1    ATGTCTTACAGTATCACTACTCC   23
TMV-R1    TATAAGATCCGGTTCCTCTG   20
17
向日葵褪绿斑驳病毒(sunflower chlorotic mottle virus)
SuCM-F1   GAGGCGTGGGGCTATCC
SuCM-R1   AAAAGTAGTACAGGAAAAGCC
18
Potyvirus简并引物
Poty-F2    ATGGTHTGGTGYATHGARAAYGG
Poty-R2    TGCTGCKGCYTTCATYTG
19
TSWV
(Tomato spotted wilt virus)番茄斑萎病毒
TSWV-F2
TSWV-R2  CA C TGGA TCC TTTTG TTTTTG TTTTTTG   28